L’utilisation d’antimicrobiens en cas de troubles intestinaux est moins souvent indiquée qu’on ne le pense généralement. Il suffit souvent de traiter les conséquences de la diarrhée (voir le chapitre sur les réhydratants). Si l’on opte néanmoins pour un traitement antimicrobien, on choisira de préférence des médicaments qui ne sont pas ou très peu résorbés par le tractus gastro-intestinal. La diarrhée peut également être provoquée par certains parasites ou protozoaires (tels que les coccidies) qui portent atteinte aux muqueuses intestinales.
Une spécialité à base de paromomycine est indiquée chez les veaux pour le traitement des infections bactériennes à E. coli et des infections à Cryptosporidium parvum.
Voir aussi Aminosides.
L’absorption orale est très faible si le tube digestif est intact. Ceci n’empêche pas que des temps d’attente soient attribués à ces préparations du fait d’une absorption même très limitée du principe actif.